Saturday, April 24, 2010

Aging journal indexed by Science Citation Index / La revista Aging indizada en el Science Citation Index

Aging, the newest open access periodical publication in the field of aging, released 15 months ago and added by the end of last year in PubMed Central, has also met the high standards of Thomson's Science Citation Index Expanded that was recently indexed by it.

Aging, la publicación periódica más reciente de acceso abierto en el campo del envejecimiento, lanzada hace 15 meses y la cual fue adicionada a finales del año pasado en PubMed Central, también ha cumplido con los altos estándares de Thomson's Science Citation Index Expanded que fue indizada recientemente por éste.

Friday, April 23, 2010

A novel naturally occurring indole with anti-aging properties / Un indole nuevo de origen natural con propiedades anti-envejecimiento

Indole-3-propionic acid (IPA), related to melatonin but which largely surpasses its antioxidant effects, was discovered in 1999 in the plasma and cerebrospinal fluid of humans and has been attributed a potent neuroprotective effect against deposition of amyeloid beta-protein, hallmark of Alzheimer’s disease. In order to improve the bioavailability of this compound, the group led by Pappolla, recently reported a new amphiphilic indol substance, IPAM, able to cross biological membranes and which in contrast to melatonin has long half-life and no pro-oxidant activity. Surprisingly, it was found that this molecule is also present in rat brain and confers the following anti-aging effects in mammalian mitochondrial:

1) Reverts age-dependent decline of rat mitochondrial proton motive force and energetic capacity.

2) Antagonizes toxin-induced mitochondrial damage in young and old mice brains triggered by the electron transport inhibitors such as doxorubicin and antimycin A, and the proton potential dissipater carbonylcyanide-p-trifluoromethoxyphenylhydrazone (FCCP).

3) Increases the activity of mitochondrial Complex I —generator of half the amount of free radicals produced by the mitochondria— and Complex IV, activities that tend to diminish through the course of aging.

4) Poses a potent antioxidant effect with no pro-oxidant intermediaries detected in vitro.

Furthermore, Poeggeler et al. used microscopic rotifers as an aging model system to explore the effect of IPAM on longevity and found that animals treated with this compound have increased size, fertility and 300% longer lifespan than their untreated peers. Additional insights into the biochemical mechanisms underling the effects of this indole will determine whether oxidative stress reduction is indeed the main cause of these anti-aging effects, or if rather deregulation of other molecular pathways leads to this phenotype.


IPAM increases lifespan in rotifers/ IPAM incrementa la esperanza de vida en rotiferos.
Poeggeler et al, 2010 URL http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0010206


El ácido indol-3-propiónico (IPA) relacionado con la melatonina pero que supera ampliamente sus efectos antioxidantes, fue descubierto en 1999 en el plasma y el líquido cefalorraquídeo de los seres humanos y se le ha atribuido un potente efecto neuroprotector de la deposición de proteina beta amiloide, sello distintivo de la enfermedad de Alzheimer. Con el fin de mejorar la biodisponibilidad de este compuesto, el grupo dirigido por Pappolla reportó recientemente una nueva sustancia indol anfifílica, IPAM, capaz de atravesar las membranas biológicas y que, en contraste con la melatonina tiene una vida media larga y sin actividad pro-oxidante. Sorprendentemente, se descubrió que esta molécula también está presente en cerebro de rata y confiere los siguientes efectos anti-envejecimiento en las mitocondrias de mamíferos:

1) Revierte la disminución de la fuerza proton-motriz y la capacidad energética de la mitocondria de rata que se presenta con la edad.

2) Antagoniza el daño mitocondrial inducido por toxinas en el cerebro de ratones jóvenes y viejos provocado por los inhibidores de transporte de electrones, como la doxorrubicina y la antimicina A, asi como por el disipador del potencial de protones, carbonylcyanide-p-trifluoromethoxyphenylhydrazone (FCCP).

3) Aumenta la actividad del Complejo I mitocondrial —generador de la mitad de la cantidad de radicales libres producidos por las mitocondrias— y del complejo IV, actividades que tienden a disminuir en el curso del envejecimiento.

4) Posee un efecto antioxidante potente sin intermediarios pro-oxidantes detectado in vitro.

Por otra parte, Poeggeler et al. utilizaron rotíferos como un sistema modelo de envejecimiento para explorar el efecto del IPAM sobre la longevidad y encontraron que los animales tratados con este compuesto presentan un aumento en tamaño, la fertilidad y la esperanza de vida se extiende un 300% en compración con los controles no tratados. Indicios adicionales sobre los mecanismos bioquímicos que subyacen a los efectos de este indol determinará si la reducción del estrés oxidativo es la causa principal de estos efectos anti-envejecimiento, o si más bien la desregulación de otras vías moleculares promueven este fenotipo.


Chyan, Y. J., Poeggeler, B., Omar, R. A., Chain, D. G., Frangione, B., Ghiso, J., & Pappolla, M. A. (1999). Potent neuroprotective properties against the alzheimer beta-amyloid by an endogenous melatonin-related indole structure, indole-3-propionic acid. The Journal of biological chemistry , 274 (31), 21937-21942. URL http://dx.doi.org/10.1074/jbc.274.31.21937

Poeggeler, B., Sambamurti, K., Siedlak, S. L., Perry, G., Smith, M. A., & Pappolla, M. A. (2010). A novel endogenous indole protects rodent mitochondria and extends rotifer lifespan. PLoS ONE , 5 (4), e10206+. URL http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0010206

Tuesday, April 6, 2010

Signs of replicative aging in the bacteria E.coli / Indicios de envejecimiento replicativo en la bacteria E. coli



Potential aging factors in
E. coli binary fission / Factores potenciales de envejecimiento en la fision binaria de E. coli. Nyström, T. (2007) URL http://dx.doi.org/10.1371/journal.pgen.0030224

It was long considered that bacteria, which reproduce by symmetrical binary fission like E. coli, do not experience replicative aging, however by tracking the poles of dividing cells it was demonstrated that growth rates of sibling bacteria are different. Those cells that inherit the old poles show decrease fitness (growth rates) compared with the ones derived from new poles, thus demonstrating signs of replicative aging. Still remains to discover which are the factors involved in bacteria replicative aging and if these may share similar molecular mechanisms with other unicellular model organisms.


Durante mucho tiempo se consideró que las bacterias que se reproducen por fisión binaria simétrica como E. coli no presentan envejecimiento replicativo, sin embargo mediante el seguimiento de los polos de las células en división se demostró que la tasa de crecimiento de las bacterias descendientes o hermanas son diferentes. Aquellas células que heredan el polo viejo muestran disminución en su estado físico (tasa de crecimiento) en comparación con las derivadas del polo nuevo, lo cual demuestra signos de envejecimiento replicativo. Aun falta por descubrir cuales son los factores que participan en el envejecimiento replicativo bacteriano y si estos pudieran compartir mecanismos moleculares similares con otros organismos modelo unicelulares.


Nyström, T. (2007). A bacterial kind of aging. PLoS genetics, 3 (12). URL http://dx.doi.org/10.1371/journal.pgen.0030224

Monday, April 5, 2010

The bacterial homolog of the longevity gene Sir2 regulates chemotaxis/El homologo del gen de longevidad Sir2 en bacterias regula la quimiotaxis

Although the first insight into Sir2 enzymatic activity came from CobB, the Sir2 homolog in bacteria, the physiological role of bacterial sirtuins has remained unclear. Li et al., recently showed that CobB from E. coli regulates bacteria response to different chemicals in the milieu by deacetylating and thus covalently modifying CheY, the response regulator that transduces the signal from the receptors to the flagella. According to this, deletion of cobB gene reduces bacteria chemotactic responses.

Since environment plays an important role on aging, it will be interesting to determine whether changes in chemotaxis parallel E.coli replicative aging, and whether sirtuins or additional conserved longevity pathways are involved in the regulation of this phenomenon.



Aunque los primeros análisis sobre la actividad enzimática de Sir2 provienen de CobB, el homologo de Sir2 en bacteria, el papel fisiológico de las sirtuinas bacterianas se desconoce. Li et al., recientemente demostraron que CobB de E. coli regula la respuesta bacteriana a diferentes sustancias químicas en el medio por medio de la desacetilación y por lo tanto modificación covalente de CheY, el regulador de la respuesta que transduce la señal de los receptores a los flagelos. De acuerdo con esto, la supresión del gen cobB reduce la respuesta quimiotáctica bacteriana.

Puesto que el medio ambiente juega un papel importante en el envejecimiento, sería interesante determinar si cambios en la quimiotaxis están relacionados con el envejecimiento replicativo de E. coli , y si las sirtuinas u otras vías de longevidad conservadas participan en este fenómeno.

Li, R., Gu, J., Chen, Y.-Y. Y., Xiao, C.-L. L., Wang, L.-W. W., Zhang, Z.-P. P., Bi, L.-J. J., Wei, H.-P. P., Wang, X.-D. D., Deng, J.-Y. Y., & Zhang, X.-E. E. (2010). Cobb regulates escherichia coli chemotaxis by deacetylating the response regulator chey. Molecular microbiology. URL http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2958.2010.07125.x

Thursday, April 1, 2010

Nature and Science team up on a new open access journal/La revistas Nature and Science se unen en un nueva revista de acceso abierto

Science and Nature, two of the scientific journals with highest impact in basic science and witnesses of the biogerontological evolution, by publishing several of the most relevant papers on the field, give us today the great news of teaming up on a new Open Access journal called either Scientific Nature or Natural Science that will use semantic Web 3.0 technologies. Here is the news in the words of ScienceNOW:
“Science and Nature have ended their historic battle for the world’s best basic science articles, agreeing to cease their respective publications and co-launch an open-access, online-only journal with an innovative democratic peer-review system, sources at both journals revealed this morning.

"The difficult economics of scientific publishing today did play a role in this decision, but we also saw an opportunity to create a Web 3.0 basic sciences journal for the next generation of researchers," says Havel Affe, the geneticist who has agreed to become the journal’s editor-in-chief. "We predict the journal will become the dominant force in scientific publishing".

“The new journal will be called either Scientific Nature or Natural Science depending on the result of a text-message vote by the scientific community”.
April fools' day news. No doubt Science knows the dreams of many of their readers. Could this become real soon?



The blog ciberliter@tur@ UNAM, specialized in cyberinfrastructure and electronic resources for e-research, considers that:
"This is another evidence of how digital information revolution is impacting the dynamic, structure and publication of science"


Science y Nature, dos de las revistas científicas con mayor impacto en la ciencia básica y testigos de la evolución biogerontologica al publicar varios de los artículos más relevantes en el campo, nos dan hoy la gran noticia de asociarse en una nueva revista de acceso abierto llamada ya sea Scientific Nature o Natural Science que utilizará las tecnologías semánticas de la Web 3.0. Aquí está la noticia en las palabras de ScienceNOW:
"Science y Nature han terminado su batalla histórica por los mejores artículos de ciencias básicas en el mundo, comprometiéndose a poner fin a sus respectivas publicaciones y al co-lanzamiento de una revista de libre acceso en línea con un innovador sistema democrático de revisión por pares, las fuentes de ambas revistas revelaron esta mañana”.
"La actuales dificultades económicas que enfrenta la publicación científica tuvo un papel en esta decisión, pero también hemos visto una oportunidad de crear una revista de ciencias básicas con tecnología Web 3.0 para la próxima generación de investigadores", dice Havel Affe, genetista que ha aceptado convertirse en el editor en jefe de la revista. "Prevemos que la revista se convertirá en la fuerza dominante en la publicación científica".

"La nueva revista se llamará ya sea Scientific Nature o Natural Science en función del resultado de una votación de mensaje de texto por la comunidad científica".

El blog ciberliter@tur@ UNAM, especializado en ciberinfrastructura y recursos electrónicos para la e-investigación , considera que:
“Esta es otra de las evidencias de la repercusión [que ha tenido] la revolución de la información digital en la ciencia, en su estructura, dinámica y publicación”.

Esta es una broma elaborada por Science para el dia de los inocentes que se celebra hoy en varios paises del mundo. No cabe duda que la revista conoce los sueños de muchos de sus lectores. Estos se harán realidad pronto?